Зоонозные инфекции

Зоонозные инфекции описывают передачу вируса от животного к человеку. Большинство известных случаев было связано с прямым или косвенным контактом с инфицированными живыми или мертвыми птицами. Наиболее часто до людей добираются вирусы птичьего, свиного и других зоонозных гриппов. У человека они могут вызывать заболевания верхних дыхательных путей разной тяжести, от лихорадки и кашля до тяжелой пневмонии и смерти. Эти вирусы входят в состав гриппа группы А и являются наиболее значимыми для здравоохранения, поскольку могут вызвать пандемию гриппа. Наиболее известные случаи – это испанский грипп 1918 года и пандемия свиного гриппа 2009 года.

Мы обратились к статьям, посвящённым зоонозным инфекциям. Для обзора мы выполнили систематический поиск литературы в базе данных Scopus и построили карту публикаций на основе их списков литературы (см. Рисунок 1). Близость на карте и принадлежность к одному кластеру на этой карте означают, что публикации ссылаются на одни и те же работы – а значит, есть вероятность, что в статьях поднимаются схожие темы. Карта выполнена в программе VOSviewer.

Публикации дробятся на пять кластеров:

• цвет морской волны, по центру: эпидемиология, вирусология и генетические анализы (коронавирусы и другие вирусы),
• фиолетовый, справа сверху: вирусы гриппа свиного происхождения,
• жёлтый, справа снизу: вирусы гриппа птичьего происхождения,
• голубой, слева: герпесвирусы (вирусы гепатита Е),
• синий, второй слева: условно-патогенные инфекции.

Большинство публикаций расположено в правой части карты. Фиолетовый кластер (справа сверху) и жёлтый кластер (справа внизу) расположены близко друг к другу, потому что оба они про грипп. Они тесно связаны с кластером цвета морской волны (по центру), поскольку в нем содержатся публикации, описывающие патогены с наибольшим зоонозным потенциалом, в том числе вирус гриппа А. Синий (второй слева) и голубой (слева) кластеры расположены в отдалении от фиолетового и жёлтого кластера, поскольку там речь идет о других типах инфекций с другими последующими заболеваниями.

Описание кластеров

Кластер цвета морской волны включает в себя статьи про различные типы вирусов, такие как генипавирусы, ротавирусы и коронавирусы. Очень много публикаций посвящено вирусологии и генетическому разнообразию вирусов, особенно их геномам. Многие работы также описывают возникновение и возрождение вирусов, их эпидемиологию и пути передачи. Можно заметить, что отдельное внимание уделяется вирусам, передаваемым летучими мышами. Эти работы расположены в нижней части кластера. Что касается коронавирусов, то многие из них связаны с передачей вируса от верблюдов человеку.

Фиолетовый кластер, посвящённый вирусам гриппа свиного происхождения, подчёркивает необходимость усиления эпиднадзора и дальнейших исследований. Многие из публикаций здесь связаны с пандемией свиного гриппа в 2009 году.

Жёлтый кластер описывает вирусы гриппа птичьего происхождения, их эпидемиологию, происхождение, распространение и потенциал. Некоторые публикации также описывают их генетику и молекулярную структуру.

Голубой кластер освещает семейство герпесвирусов, вызывающих в основном гепатит Е. Публикации охватывают их происхождение, характеристики, способы передачи инфекции, последствия и профилактику. Большинство переносчиков, изученных в публикациях, это свиньи. Основной массив публикаций появился в 1990-х. Наиболее цитируемая публикация этого кластера описывает связь между новым вирусом гепатита Е у свиней и вирусом гепатита Е человека (Meng et al. 1997).

Синий кластер посвящён условно-патогенным инфекциям, которые обычно затрагивают только людей с ослабленным иммунитетом. Большинство публикаций посвящено изучению людей с ВИЧ и раком. В публикациях также описываются молекулярная эпидемиология и генетические особенности этих инфекций.

Общие обзоры на тему зоонозных инфекций

• Greger, Michael. 2007. ‘The Human/Animal Interface: Emergence and Resurgence of Zoonotic Infectious Diseases’. Critical Reviews in Microbiology 33(4):243–99.
• Jones, Kate E., Nikkita G. Patel, Marc A. Levy, Adam Storeygard, Deborah Balk, John L. Gittleman, and Peter Daszak. 2008. “Global Trends in Emerging Infectious Diseases.” Nature 451(7181):990–93.
• Lloyd-Smith, James O., Dylan George, Kim M. Pepin, Virginia E. Pitzer, Juliet R. C. Pulliam, Andrew P. Dobson, Peter J. Hudson, and Bryan T. Grenfell. 2009. ‘Epidemic Dynamics at the Human-Animal Interface’. Science 326(5958):1362–67.
• Morens, David M., Gregory K. Folkers, and Anthony S. Fauci. 2004. ‘The Challenge of Emerging and Re-Emerging Infectious Diseases’. Nature 430(6996):242–49.
• Taylor, Louise H., Sophia M. Latham, and Mark E. J. Woolhouse. 2001. “Risk Factors for Human Disease Emergence.” Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences 356(1411):983–89.
• Woolhouse, Mark E. J., and Sonya Gowtage-Sequeria. 2005. “Host Range and Emerging and Reemerging Pathogens.” Emerging Infectious Diseases 11(12):1842–47.

На странице 2 мы даём ссылки на важные работы в каждом кластере.