Препринты о COVID-19: как меняются темы (июньская версия)

К последствиям локдауна и испытаниям лекарств

Когда во всём мире чрезвычайная ситуация, исследователи стремятся публиковать свои результаты в свободном доступе и как можно быстрее. Доступный вариант – опубликовать препринт, работу, которая ещё не прошла рецензию и оценку качества, зато быстро попадает в открытый доступ онлайн. В этом посте мы показываем, на какие тематики дробятся препринты о коронавирусе SARS-CoV-2 и вызванном им заболевании COVID-19, и как эти темы менялись с февраля по июнь 2020 года. Про наши данные и методы читайте на странице 3.

В обзоре мы, где возможно, приводим в качестве источников препринты систематических обзоров и мета-анализов. Подчеркнём, что приведённые исследования не прошли экспертную оценку, и ими не следует руководствоваться на практике.

В майском обзоре мы отметили, что внутри массива работ про распространение COVID-19 выделилось два направления: модели передачи вируса и нефармацевтических мер контроля над эпидемией, и только-только набирающие популярность исследования социально-психологических последствий пандемии. При этом сохранялись объёмные блоки материалов по вирусологии и клинической медицине.

Сегодня мы показываем, как за последний месяц изменилось соотношение работ по разным темам. Для этого мы используем тематическое моделирование и анализируем заголовки и аннотации препринтов. Алгоритм статистически оценивает на текстовых данных, насколько близки друг другу используемые слова, и автоматически группирует их в кластеры. Эти кластеры мы можем интерпретировать как содержательные темы.

Мы пользуемся алгоритмом структурного тематического моделирования, который для каждого документа показывает, какие темы для него специфичны, и для каждой темы – какие слова для неё наиболее характерны. Таким образом, мы можем оценить, в какой пропорции в наших данных присутствует та или иная тема. Алгоритм также позволяет проанализировать, как на распределение тем влияют характеристики текстов: в нашем случае, это платформа, где препринт опубликован, и дата публикации.

Тематики препринтов

Взяв тексты аннотаций и заголовков препринтов, мы построили модель, которая выделила в этих данных 20 тем. На Рисунке 1 они отсортированы по тому, насколько выражено их присутствие в массиве препринтов. Каждая тема сопровождается пятью самыми характерными для неё терминами.

Тема социально-экономических последствий эпидемии продолжает лидировать в массиве текстов. С течением времени начинают появляться статистические данные, например, о состоянии экономики. Поэтому исследования, где эта тема стречается, посвящены уже не только преступности, но и влиянию локдауна на экономику и жизнь разных социальных групп, а также влиянию социальных характеристик на поведение в пандемию (подробнее – на странице 2 обзора).

На фоне остальных стали ярче темы про психологические последствия эпидемии и средства индивидуальной защиты. За время карантина собраны данные для лонгитюдных исследований стресса и тревожности в общем у населения и у медицинского персонала в частности. Что касается масок и средств индивидуальной защиты (СИЗ), если прежние работы в основном анализировали СИЗ в контексте больницы, то с постепенным выходом стран из локдауна появились данные о том, как ношение масок влияет на распространение вируса в обществе.

Тематические контексты

В каких контекстах темы обсуждаются в препринтах, можно оценить по Рисунку 2. Размер узла в этой сети соответствует относительной популярности темы в массиве препринтов, как и на Рисунке 1. Плотность линий показывает силу связи между темами, исходя из их совместной встречаемости в препринтах.

По сравнению с прошлым обзором, исследования социально-экономических последствий карантина стали отчётливее связаны с нефармацевтическими интервенциями. Заметны и изменения в биолого-медицинской части карты. Препринты о клинических проявлениях болезни становятся ближе к исследованиям молекулярных механизмов и генетики вируса. Это связано с тем, что появляются мета-анализы и данные о клинических эффектах потенциальных лекарств против COVID-19, а также о том, как лекарства от других болезней взаимодействуют с вирусом.

Например, препараты от гипертонии – ингибиторы ангиотензинпревращающего фермента (АПФ) и блокаторы рецепторов ангиотензина (БРА) II. Их выписывают, чтобы предотвратить вредное воздействие гормона ангиотензина на стенки сосудов. Однако, чтобы разрушить ангиотензин, эти лекарства стимулируют выработку АПФ2, который является «точкой входа» коронавируса в организм, его мишенью. Из-за этого высказывались опасения, не ухудшат ли ингибиторы АПФ состояние пациентов с COVID-19, сделав их более уязвимыми для вируса.

Тем не менее, в ряде исследований и систематических обзоров отмечается, что эти препараты не повышают риск смертности, при этом снижают тяжесть заболевания (Abdulhak et al. 2020; Choi et al. 2020; Diaz-Arocutipa, Saucedo-Chinchay, and Hernandez 2020). В новом препринте систематического обзора Qu et al. (2020) также не нашлось подтверждений тому, что препараты ухудшают состояние пациентов. И напротив, обнаружились свидетельства в пользу того, что приём ингибиторов АПФ снижает у пациентов риск смертности. Исследователи рекомендуют по крайней мере не прекращать приём этих препаратов, если заболевшие COVID-19 уже принимали их.

Читайте на странице 2, как со временем меняется относительная выраженность тематик препринтов и на какие темы препринты публиковались в последний месяц.