Перейти к контенту

Препринты о COVID-19: как меняются темы (апрельская версия)

От связывания вируса до моделей снятия карантина

Когда во всём мире чрезвычайная ситуация, исследователи стремятся публиковать свои результаты в свободном доступе и как можно быстрее. Доступный вариант – опубликовать препринт, работу, которая ещё не прошла рецензию и оценку качества, зато быстро попадает в открытый доступ онлайн. В этом посте мы показываем, на какие тематики дробятся препринты о коронавирусе SARS-CoV-2 и вызванном им заболевании COVID-19, и как эти темы менялись с января по апрель 2020. Про наши данные и методы читайте на странице 2.

На какие группы делятся препринты

С середины января, когда появились первые работы о новом коронавирусе, по середину апреля вопросы, обсуждаемые в препринтах, устойчиво дробились на три основных области (см. Рисунки 1–3). А именно:

  • кластер цвета морской волны: вирусология и молекулярная биология, где обсуждается сам вирус и вызванные им изменения на клеточном уровне;
  • оранжевый кластер: клиническая медицина, где обсуждаются вызванные вирусом болезни и их клинические характеристики;
  • фиолетовый/синий кластер: эпидемиология и исследования здравоохранения, где обсуждаются пути передачи вируса и меры сдерживания эпидемии.
Рисунок 1. Сеть совместной встречаемости ключевых слов в аннотациях препринтов о новом коронавирусе, которые были опубликованы с 19 января по 18 февраля 2020 г.
Цвет присвоен узлам в соответствии с автоматически выделенными кластерами. Связи означают, что ключевые слова встречаются совместно в одной аннотации. Размер узла соответствует релевантности ключевого слова. На рисунке отображены только те ключевые слова, которые встретились больше пяти раз во всех препринтах данного периода, а также встречались совместно не менее чем с пятью другими словами на карте. Кликните на рисунок, чтобы смотреть в полном размере (открывается в том же окне)
Рисунок 2. Сеть совместной встречаемости ключевых слов в аннотациях препринтов о новом коронавирусе, которые были опубликованы с 19 февраля по 18 марта 2020 г.
Цвет присвоен узлам в соответствии с автоматически выделенными кластерами. Связи означают, что ключевые слова встречаются совместно в одной аннотации. Размер узла соответствует релевантности ключевого слова. На рисунке отображены только те ключевые слова, которые встретились больше пяти раз во всех препринтах данного периода, а также встречались совместно не менее чем с пятью другими словами на карте. Кликните на рисунок, чтобы смотреть в полном размере (открывается в том же окне)
Рисунок 3. Сеть совместной встречаемости ключевых слов в аннотациях препринтов о новом коронавирусе, которые были опубликованы с 19 марта по 17 апреля 2020 г.
Цвет присвоен узлам в соответствии с автоматически выделенными кластерами. Связи означают, что ключевые слова встречаются совместно в одной аннотации. Размер узла соответствует релевантности ключевого слова. На рисунке отображены только те ключевые слова, которые встретились больше пяти раз во всех препринтах данного периода, а также встречались совместно не менее чем с десятью другими словами на карте. Кликните на рисунок, чтобы смотреть в полном размере (открывается в том же окне)

Как менялись темы

По рисункам заметно, что основные ключевые слова во всех кластерах остаются неизменными, при этом каждый месяц к ним добавляются другие специфические слова. Далее мы кратко опишем эти изменения, в качестве источников приводя, где возможно, опубликованные как препринты систематические обзоры литературы и мета-анализы. Подчеркнём, что приведённые исследования не прошли экспертную оценку, и ими не следует руководствоваться на практике.

Кластер цвета морской волны: молекулярная биология, иммунология, вирусология

В первых препринтах этого кластера обсуждаются механизмы связывания вируса SARS-CoV-2 с клетками: одно из ключевых слов в сети, АПФ2, это фермент некоторых клеток организма, белок, к которому прикрепляется вирус. К началу марта появляется больше препринтов, в которых описываются изменения иммунной системы заболевших. К примеру, было обнаружено, что у пациентов с COVID-19 меньше иммунных клеток, T-лимфоцитов CD4+ (см. напр. Qi et al. 2020). Сегодня появляются исследования, посвящённые разработке профилактических вакцин и использованию имеющихся лекарств для лечения пациентов с COVID-19 (см. систематический обзор в Lem et al. 2020).

Оранжевый кластер: клиническая медицина

Первые препринты рассматривают симптомы, наблюдаемые у заражённых людей. В начале февраля достаточно ясен был только диагноз, пневмония. К началу марта, когда стали выходить систематические отчёты из клиник, стали больше обсуждаться такие проявления болезни, как лихорадка, кашель и утомляемость.

Гипертония упоминается как распространённое сопутствующее заболевание, наряду с сердечно-сосудистыми заболеваниями и диабетом (Chen et al. 2020; см. систематический обзор в Jain and Yuan 2020). В последний месяц в сети появляется ключевое слово «число лимфоцитов», – недавние работы указывают на то, что низкое их число связано с тяжестью заболевания (см., например, обзор в Brown et al. 2020).

Фиолетовый кластер: эпидемиология

В первых исследованиях этого кластера освещается случай Китая и распространение вируса в этой стране. В марте в препринтах упоминаются также способы контроля над эпидемией в Китае и их эффективность. К апрелю возникают препринты о случаях США и европейских стран, где рассматриваются последствия карантина для пиков заражаемости и смертности. Также появляются работы, моделирующие сценарии выхода из карантина.

Что касается передаваемости вируса, в препринте, обобщающем данные многих стран, даётся новая оценка основному репродуктивному числу R0, то есть показателю заражаемости. В отсутствие ограничительных мер в сфере здравоохранения, R0 для нового коронавируса SARS-CoV-2 оценивается в 4,5 (Katul et al. 2020). Это почти в два раза выше, чем прежние оценки ВОЗ и ранее опубликованные оценки (напр., Layne et al. 2020).

Goldsztejn, Schwartzman, and Nehorai (2020) моделируют сценарии снятия карантина и выступают за строгий карантин для групп риска и постепенное снятие ограничений для остального населения. Lopez and Rodo (2020) приходят к похожим выводам, моделируя снятие карантина в Испании, где он был введён 14 марта, а 29 марта последовали более строгие ограничения. Авторы показывают, что наилучшая стратегия – снимать ограничения постепенно и для небольшого числа людей за раз. При этом наилучших результатов в смысле заражаемости и смертности можно добиться, если продержать карантин как минимум 45 дней – тогда, согласно модели, можно избежать второй волны эпидемии в 2020 году.

Перейдите на страницу 2, чтобы ознакомиться с нашими методами и данными.

Страницы: 1 2